Denne artikkelen er produsert og finansiert av Nord universitet - les mer.
Hoppekreps i slekten Calanus spiller en viktig rolle i økosystemene i havet. Samtidig endrer leveforholdene seg når havet blir varmere.(Foto: Mads Schultz)
Avanserte genetiske metoder ga svar på om to tilsynelatende like hoppekreps kunne pare seg med hverandre
De to artene av hoppekreps lever side om side, formerer seg på samme tid og er så like at man ikke ser forskjell på dem. Men kan de parre seg med hverandre?
Skjerstadfjorden i Nordland. Fra det smale
utløpet i Saltstraumen brer den seg vid og dyp østover mot Fauske og Rognan. Her
finner man rike forekomster av populære fiskeslag som kveite, sei og sjøørret.
Grunnlaget for denne fiskerikdommen finner vi
i den lille hoppekrepsen Calanus. Det lille dyret lever av
planteplankton og lagrer energien i form av flytende lipider, oljer. Det gjør
den til ypperlig mat for små fiskelarver.
Kan få dramatiske konsekvenser
Og nettopp her i Skjerstadfjorden finner man
flere arter av Calanus. Ikke bare den velkjente C. finmarchicus,
bedre kjent som raudåte, men også den arktiske slektningen C. glacialis.
– De to
artene er ekstremt like og har overlappende utbredelse. Med stadig varmere
klima vil disse overlappende områdene bli stadig større, sier forsker Marvin
Choquet.
De to artene er så like at man må bruke
genetiske metoder for å skille dem.
Spørsmålet nå er om arter som trives i
varmere vann, slik som C. finmarchicus, vil bre seg nordover og
eventuelt fortrenge arter som trives best ved lave temperaturer. Arter som er
nær i slekt, kan også begynne å pare seg med hverandre og gi opphav til
krysninger.
Skulle C. finmarchicus fortrenge C.
glacialis i Arktis, vil det kunne få dramatiske konsekvenser for de økosystemene i havet.
Et perfekt sted for krysninger
Men hvordan kan man vite om et bitte lite,
nesten gjennomsiktig krepsdyr, så lite at det må observeres i mikroskop, er en
krysning?
Dette spørsmålet har opptatt forskningsgruppen til professor Galice
Hoarau det siste tiåret. Ikke minst etter at det ble rapportert om funn av
hybrider av de to artene av hoppekreps langs kysten av Øst-Canada.
– Spørsmålet
om hybridisering førte til en ganske opphetet debatt, forteller Hoarau.
For da forskerne i Bodø begynte å lete etter
hybrider, fant de ingen. Selv om de sjekket prøver av dyreplankton samlet inn over
hele Nord-Atlanteren. Det fikk forskerne i Bodø til å vende blikket mot
Skjerstadfjorden.
– Vi hadde
funnet begge artene i fjorden i stort antall gjennom hele året. Vi visste også
at de ville reprodusere samtidig. Det gjorde fjorden til et perfekt sted å
lete, sier Choquet.
Fant ingen hybrider
Også prøver fra Mistfjorden nord for Bodø ble
inkludert. Men resultatet var det samme. Selv om de hentet prøver hver måned
gjennom et helt år, fant de ikke en eneste hybrid. Hvordan kunne det ha seg?
Svaret viste seg å ligge i hvilke genetiske
markører som ble brukt.
– Funnene av hybrider i Canada var basert på bruk av mikrosatellitter, forklarer Choquet.
Annonse
Så hva i all verden er mikrosatellitter? Her
kan det være greit med litt grunnleggende genetikk-kunnskaper.
Genene våre, og
hoppekrepsene sine, består av DNA. Det er bygd opp av fire ulike molekyler, kalt
nukleotider. De inneholder en av basene Adenin, Tymin, Cytosin eller Guanin.
Disse forkortes A, T, C og G og kan sammenlignes med et slags genenes
alfabet. De fire basene ligger etter hverandre langs DNA-tråden og kan leses
som den genetiske koden eller som genetiske sekvenser.
Kjempestort genom
Når forskerne bruker genetiske markører, ser
de etter helt bestemte sekvenser på DNA-tråden. De kan brukes som kjennetegn på for eksempel en bestemt art.
Mikrosatellitter er en slik markør. De består av sekvenser
som gjentas et visst antall ganger. Et slags hakk i plata. I en art kan for eksempel sekvensen ATC ligge tre ganger etter hverandre. I en annen art kan den gjentas fem ganger.
En krysning av de to artene vil da inneholde begge de to
variantene.
– Men Calanus har et svært kompleks DNA med mye
repetisjoner. Det gir utfordringer når man skal sekvensere og analysere det. Det gir en risiko for at man ser på feil regioner, forklarer Choquet.
Man kan med andre ord tro at man ser på
mikrosatellitt nummer en fra art A, som er annerledes enn mikrosatellitt 1 i art B. Dermed tror man at man har en hybrid. Men det man egentlig ser på er en mikrosatellitt
fra et helt annet sted på DNA-tråden.
– Derfor
utviklet vi seks molekylære markører, InDels, designet og testet for å brukes
på Calanus, forteller Choquet.
InDels er små sekvenser. De er gjennom
evolusjonens gang lagt til eller tatt bort fra bestemte områder på DNA-tråden.
Om DNA
DNA er arvestoffet som finnes i alle celler.
DNA inneholder oppskrifter som bestemmer hvordan organismen skal se ut og fungere. Disse oppskriftene kalles gener.
Genene videreføres fra en generasjon til den neste. Alt DNA må kopiere seg selv når nye celler dannes ved celledeling. De nye cellene har helt likt DNA.
DNA har form som en lang, dobbelttrådet heliks hvor genene ligger etter hverandre på rekke. Disse trådene er pakket tett sammen med proteiner i kromosomer.
En organismes samlede DNA kalles genomet. Hver celle i en organisme inneholder de samme oppskriftene, men ikke alle kommer til uttrykk i hver celle.
Kilde: Lene Martinsen / Store Norske leksikon
– Metoden ble
designet og testet spesielt for å lete etter Calanus-hybrider. Vi analyserte
prøver fra hele Nord-Atlanteren og det Arktiske hav uten å avdekke hybrider.
Det tydet på at de tidligere funnene var et resultat av metodefeil knyttet til
disse mikrosatellittene, sier Choquet.
Annonse
Funnene fra Bodø var likevel ikke nok til å
overbevise alle forskere verden rundt om at artene ikke hybridiserte. Det fikk
forskerne ved Nord universitet til å gå enda grundigere til verks.
– Vi
bestemte oss for å ta i bruk den virkelig store hammeren, forteller Hoarau.
I stedet for å se etter noen få, spesifikke
områder på hoppekrepsens DNA, ville de nå se på hele genomet.
– Utfordringen
er at Calanus har et veldig stort genom. I hver eneste celle er det så
mye DNA at det nesten er uoverkommelig å analysere alt. Calanus har
mellom to og fire ganger så mye genetisk informasjon som mennesker, sier
Choquet.
Bare tilsynelatende like
Løsningen ble å se etter noe som kalles «Single nucleotide
polymorphisms», forkortet SNP og uttalt snips. En snips er en variant der
kun ett enkelt nukleotid er byttet ut. Det vil si kun en av bokstavene.
For å få et godt
utvalg av slike snips, plukker man ut tilfeldige biter fra mange ulike
regioner på DNAet.
– Denne
metoden gjør at vi kan analysere tusenvis av markører fra hele DNAet. Ikke bare
fra en liten del av det slik man gjør med mikrosatellitter og InDels, sier
Choquet.
Ved å se etter snips fra områder på
DNAet som var overlappende for C.finmarchicus og C. glacialis,
fant de helt egne DNA-profiler for de to artene.
– Våre
analyser viser ingen tegn til hybridisering. Det tyder på at det er
usannsynlig at de to artene kan krysse seg, sier Choquet.
Tar du en vannprøve fra Skjerstadfjorden og
legger den under lupen, vil du sannsynligvis kunne få øye på eksemplarer av
både C. finmarchicus og C. glacialis. Men ingen krysninger.
De to artene som er prikk like på utsiden, er
så genetisk forskjellige at de antagelig ikke kan få levedyktige avkom om de
skulle pare seg med hverandre.
Annonse
– Det kan
handle om små subtile forskjeller i kjønnsorganer eller i feromoner, som vi
foreløpig vet veldig lite om, sier Choquet.
Feromon er et kjemisk stoff som avgis av en organisme til omgivelsene og som påvirker andre individer av samme art. De kalles også signalstoffer.
Nye spørsmål
At de to artene ikke krysser seg, gjør det
enklere for forskerne å studere effekten av klimaendringer på økosystemene.
– Nå som vi
vet at de ikke hybridiserer, kan vi gå videre og studere om hver art har en
eller flere populasjoner innenfor sine utbredelsesområder.
Eller, for å vende tilbake til hoppekrepsene i
Skjerstadfjorden: Lever individene av C. glacialis og C. finmarchicus
isolert inne i fjorden, avskjermet fra sine artsfrender ute i åpent hav? Eller
skjer det en utveksling der individer fra andre områder kommer til og blander
genene sine med «fjordboerne»? Vandrer «fjordboerne» ut i Norskehavet og sprer
genene sine der?
Dette er viktig kunnskap for å forstå hvor stabilt et
økosystem er.
– Å få
oversikt over det genetiske samspillet innen en art, på tvers av
utbredelsesområdet, er første skritt for å forstå i hvilken grad arten kan
motstå miljøendringer, slår Choquet fast.